تشکیلات مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان تهران در قالب 3 معاونت: پژوهش و فناوری، برنامه ریزی و مدیریت منابع انسانی و آموزش؛ ساماندهی شده که بر همین اساس هریک از این معاونت ها به ترتیب شامل: بخش های تحققیقاتی، واحدهای اجرایی و واحدهای آموزشی؛ خدمات خود را ارائه می نمایند .
